SARS CoV-2 pandemija: koronavirusne infekcije u životinja i veterinarski odgovor u Sloveniji

Ivan Toplak
University of Ljubljana, Veterinary Faculty, Institute of Microbiology and Parasitology, Ljubljana, Slovenia
e-mail: ivan.toplak@vf.uni-lj.si

26.11.2020.

“Genetska i antigena sličnost nekih koronavirusa (CoV) očita je među životinjskim i ljudskim sojevima. No, ponekad se CoV životinja može prenijeti na ljude, a zatim proširiti među ljudima, poput SARS-a, MERS-a i novog virusa humanog koronavirusa (SARS-CoV-2).
SARS-CoV-2 prvi je put identificiran u prosincu 2019. u gradu Wuhan u Kini, a zatim se za nekoliko mjeseci proširio cijelim svijetom, proizvevši najveći pandemijski događaj u prošlom stoljeću.

CoV su velika porodica virusa koja su česta u različitim vrstama životinja, uključujući goveda, svinje, mačke, pse, ptice, tvor, deve i šišmiše.
Od 2008. godine analiza sekvence visoko konzerviranog RNA ovisnog gena RNA polimeraze ili kompletnog određivanja genoma provedena je na nekoliko životinjskih CoV (svinje, goveda, mačke) u Sloveniji.

Svi CoV identificirani 2008. godine u uzorcima fecesa šišmiša potkovnjaka (Rhinolophus hipposideros) genetski su usko povezani, 99,5% do 100% nukleotidne sličnosti i pripadaju rodu Betacoronavirus, u CoV klaster sličan SARS-u i dijele 95,67 – 96,19% nukleotidni identitet s Rhinolophus hipposideros CoV iz Španjolske i Italije, usko povezanim sojevima u GenBank-u.

Slovenija je s dva milijuna stanovnika jedna od najmanjih zemalja Europske unije.
Prvi laboratorijski pozitivan slučaj SARS-CoV-2 u ljudi otkriven je 4. ožujka 2020. Od ožujka do 12. studenog 2020. laboratorijski je potvrđeno ukupno 50.864 slučajeva pozitivnih slučajeva SARS-CoV-2 u ljudi i zabilježeno je 686 smrtnih slučajeva.

Tijekom prvog vala epidemije SARS-CoV-2 kod ljudi, s maksimalno 70 dnevnih slučajeva 27. ožujka 2020. u Sloveniji, u zemlji je provedeno nekoliko mjera kontrole i uspješno smanjen broj prijavljenih slučajeva na nulu do početka svibnja 2020. Općenita preventivna mjerenja predložena su i vlasnicima kućnih ljubimaca i farmerima, s ciljem smanjenja rizika prijenosa sa zaražene osobe na osjetljive životinje.

Drugi val SARS-CoV-2 započeo je u srpnju 2020. godine, povećanjem broja dnevno prijavljenih pozitivnih slučajeva u ljudi na maksimalnih 2.612 slučajeva 28. listopada 2020. Od svibnja 2020., dva veterinarska laboratorija provode laboratorijske protokole za brzo i pouzdano otkrivanje infekcije SARS-CoV-2 u kliničkim uzorcima porijeklom od životinja. Tijekom epidemije u Sloveniji nisu utvrđeni klinički slučajevi SARS-CoV-2 niti laboratorijski pozitivne životinje.

Od travnja 2020. godine, sve važne informacije za veterinare, vlasnike kućnih ljubimaca i farmere redovito se ažuriraju na posebnoj web stranici koronavirusa Veterinarskog fakulteta Sveučilišta u Ljubljani.

“Genetic and antigenic similarity of some coronaviruses (CoV) is evident among animal and human strains. But rarely, animal CoV can be transmitted to humans and then spread between people such as with SARS, MERS, and new human coronavirus virus (SARS-CoV-2).
SARS-CoV-2 was identified for the first time in in December 2019 in city Wuhan in China and then in few months spread all over the world, producing the biggest pandemical event in last century. CoV are a large family of viruses that are common in different species of animals, including cattle, pigs, cats, dogs, birds, ferrets, camels, and bats. Since 2008 sequence analysis of highly conserved RNA dependent RNA polymerase gene or complete genomes determination have been done in several animal CoV (pigs, cattle, cats) in Slovenia. All CoV identified in 2008 in horseshoe bat (Rhinolophus hipposideros) fecal samples has been genetically closely related, with 99.5 % to 100 % nucleotide identity to each other and belong to genus Betacoronavirus, into SARS-like CoV cluster, and sharing 95.67 – 96.19 % nucleotide identity with Rhinolophus hipposideros CoV from Spain and Italy, the closely related strains in GenBank. Slovenia is with two million inhabitants one of the smallest countries in European Union. The first laboratory positive human case of SARS-CoV-2 was detected on March 4^th, 2020. From March to November 12^th, 2020 a total 50.864 SARS-CoV-2 human positive cases were laboratory confirmed and 686 human deaths were reported. During first wave of SARS- CoV-2 of epidemy in humans, with maximum 70 daily cases on March 27^th, 2020 in Slovenia, several control measures were implemented in a country and successfully reduced number of reported cases on 0 until beginning of May 2020. The general preventive measurements were suggested also to pet owners and farmers, with aim to reducing risk of transmission from infected person to susceptible animals. The second wave of SARS-CoV-2 started in July 2020, by increasing number of daily reported human positive cases to maximum 2.612 cases on October 28^th, 2020. Since May 2020 two veterinary laboratories have been implemented laboratory protocols for fast and reliable detection of SARS-CoV-2 infections in clinical samples of animals. No SARS-CoV-2 clinical cases or laboratory positive animals were identified during human epidemy in Slovenia. Since April 2020, all important information for veterinarians, pet owners and farmers are regularly updated on special coronavirus web page of Veterinary Faculty University of Ljubljana.

Vezano (koronavirus):

• Epizootiološki čimbenici infekcije respiratornim koronavirusom pasa u Republici Hrvatskoj
• Seroprevalencija respiratornog koronavirusa pasa u Hrvatskoj
• Humani koronavirusi u kontekstu ‘Jednog zdravlja’
• Emergentne zoonoze uzrokovane koronavirusima
• Prevalencija i molekularna epidemiologija SARS-CoV-2 na području Hrvatske

---

vidi sve →